MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Geobacter lovleyi SZ plasmid pGLOV01

Total Repeats: 204

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010815	TC	3	6	48	53	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010815	TGG	2	6	172	177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010815	ATC	2	6	306	311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010815	GTG	2	6	400	405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010815	ACA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010815	TC	3	6	575	580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010815	GCT	2	6	616	621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010815	TATT	2	8	691	698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010815	A	6	6	733	738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010815	GCA	2	6	756	761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010815	ATG	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010815	TCT	2	6	846	851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010815	ATC	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010815	TTG	2	6	903	908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010815	GCG	2	6	928	933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010815	GGA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010815	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010815	AT	3	6	1023	1028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010815	AGCAC	2	10	1044	1053	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010815	GCA	2	6	3152	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010815	A	7	7	13463	13469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010815	ATC	2	6	13570	13575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010815	TCT	2	6	13582	13587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010815	TCC	2	6	13601	13606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010815	ATT	2	6	13637	13642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010815	GCG	2	6	13663	13668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010815	TGATT	2	10	13736	13745	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010815	CAA	2	6	13831	13836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010815	TGT	2	6	13849	13854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010815	TGG	2	6	13880	13885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010815	GCC	2	6	13899	13904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_010815	TGC	2	6	13916	13921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010815	GAT	2	6	13938	13943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010815	T	6	6	13954	13959	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010815	T	6	6	14055	14060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010815	CAAC	2	8	14061	14068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010815	TCC	2	6	14118	14123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010815	GTT	2	6	14442	14447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010815	T	6	6	14446	14451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010815	GAT	2	6	14517	14522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010815	TGT	2	6	14616	14621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010815	TAA	2	6	14636	14641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010815	TAC	2	6	14653	14658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010815	CTC	2	6	14761	14766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010815	AAT	2	6	14767	14772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010815	CAAA	2	8	14779	14786	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010815	ACT	2	6	15846	15851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010815	GT	3	6	15867	15872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010815	C	7	7	15905	15911	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_010815	GTTTG	2	10	15953	15962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010815	GTC	2	6	17211	17216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010815	ACT	2	6	18593	18598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010815	AAT	2	6	18640	18645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010815	GTT	2	6	18651	18656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010815	GAC	2	6	18670	18675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010815	CTTT	2	8	18678	18685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010815	GTCC	2	8	18730	18737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010815	CTAC	2	8	30234	30241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010815	GTT	2	6	30272	30277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010815	GTG	2	6	30285	30290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010815	A	7	7	30376	30382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010815	AAC	2	6	30476	30481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010815	TCT	2	6	30495	30500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010815	TCC	2	6	30514	30519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_010815	GTT	2	6	30551	30556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010815	GCG	2	6	30577	30582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010815	GAT	2	6	30734	30739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010815	GGT	2	6	33136	33141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010815	GTT	2	6	33174	33179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010815	GAA	2	6	33263	33268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010815	GTC	2	6	33278	33283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010815	GGT	2	6	33289	33294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010815	ACC	3	9	33302	33310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_010815	GGC	2	6	34388	34393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010815	ACG	2	6	34419	34424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010815	GA	3	6	34459	34464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010815	GGT	2	6	34471	34476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010815	CAG	2	6	34486	34491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010815	TGAT	2	8	34498	34505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010815	TTTCA	2	10	34637	34646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_010815	CGTT	2	8	34705	34712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010815	G	6	6	34735	34740	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010815	GGC	2	6	34755	34760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010815	ATT	2	6	37435	37440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010815	TGG	2	6	37472	37477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010815	CGT	2	6	37793	37798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010815	GC	3	6	37802	37807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010815	GCTC	2	8	37815	37822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010815	GAC	2	6	37828	37833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010815	CTG	2	6	37846	37851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010815	AAT	2	6	37982	37987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010815	CAA	2	6	38075	38080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010815	ATA	2	6	38100	38105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010815	ATAA	2	8	38112	38119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010815	TAAA	2	8	38129	38136	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010815	GTG	3	9	38182	38190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010815	ACAAT	2	10	38203	38212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010815	TG	4	8	38226	38233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010815	ATT	2	6	38246	38251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010815	TATT	2	8	39575	39582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010815	TATAT	2	10	39590	39599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010815	TTG	2	6	39681	39686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010815	TGT	2	6	39704	39709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010815	TGC	2	6	39748	39753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010815	ACA	2	6	39775	39780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010815	TTA	2	6	39795	39800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010815	TA	3	6	39799	39804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010815	TATG	2	8	39816	39823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010815	GCAT	2	8	39859	39866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010815	ATTGT	2	10	39925	39934	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010815	TCC	2	6	41012	41017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010815	TGG	2	6	41044	41049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010815	TGT	2	6	41050	41055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010815	ACAAT	2	10	41060	41069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010815	TA	3	6	41102	41107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010815	TGA	2	6	41132	41137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010815	GT	3	6	41144	41149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010815	TA	3	6	44240	44245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010815	TA	3	6	44279	44284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010815	AT	3	6	45796	45801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010815	ATT	3	9	45809	45817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010815	AT	3	6	45822	45827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010815	TTA	2	6	45830	45835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010815	ATA	2	6	45841	45846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010815	A	7	7	49255	49261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010815	AT	3	6	49275	49280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010815	TAAA	2	8	49315	49322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010815	AAT	2	6	49335	49340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010815	CAAA	2	8	49364	49371	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010815	GCG	2	6	49375	49380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010815	CT	3	6	49389	49394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_010815	GTT	2	6	49479	49484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010815	AAAT	2	8	49564	49571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010815	AG	3	6	49582	49587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010815	TCC	2	6	51817	51822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_010815	AGG	2	6	51837	51842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010815	TA	4	8	51868	51875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010815	A	6	6	51894	51899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010815	CAAA	2	8	51900	51907	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010815	TGT	2	6	51923	51928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010815	TG	3	6	51933	51938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010815	CATT	2	8	51953	51960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010815	GGTT	2	8	55054	55061	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010815	CAT	2	6	55072	55077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_010815	CCT	2	6	55166	55171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_010815	T	6	6	55171	55176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010815	GCC	2	6	55190	55195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_010815	TGCG	2	8	55208	55215	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010815	GATT	2	8	55297	55304	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010815	GCT	2	6	55439	55444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_010815	TCC	2	6	56041	56046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_010815	ACT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_010815	T	7	7	56567	56573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_010815	A	6	6	56574	56579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010815	T	6	6	56880	56885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010815	TGA	2	6	57348	57353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010815	TTG	2	6	57357	57362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010815	T	6	6	57489	57494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010815	A	6	6	57527	57532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010815	GAT	2	6	57546	57551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010815	ACA	2	6	57564	57569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010815	CTT	2	6	58198	58203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_010815	TGT	2	6	58566	58571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010815	GAT	2	6	58664	58669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010815	TTC	2	6	58689	58694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_010815	AAG	2	6	58727	58732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010815	TCA	2	6	58746	58751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_010815	GAT	2	6	58786	58791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010815	AGG	2	6	59136	59141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010815	CATA	2	8	59227	59234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_010815	T	6	6	59947	59952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_010815	TGA	2	6	59961	59966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010815	CTC	2	6	61500	61505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_010815	GAT	2	6	61519	61524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010815	ATC	2	6	61579	61584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_010815	TTGC	2	8	63656	63663	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_010815	AGA	2	6	63684	63689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010815	GGC	2	6	63701	63706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_010815	GAT	2	6	63739	63744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_010815	GGGGT	2	10	63771	63780	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010815	TGA	2	6	63796	63801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010815	GGA	2	6	63836	63841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010815	CTC	2	6	67362	67367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_010815	TCACA	2	10	67421	67430	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_010815	TGG	2	6	67451	67456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010815	GAATC	2	10	67460	67469	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_010815	CCG	2	6	67488	67493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_010815	GA	3	6	72105	72110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
189	NC_010815	AAC	2	6	72128	72133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_010815	GTT	2	6	72145	72150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010815	GA	3	6	72158	72163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010815	A	6	6	72163	72168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010815	T	6	6	73323	73328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010815	TTC	2	6	73644	73649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_010815	GTTT	2	8	73656	73663	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
196	NC_010815	ACGA	2	8	75418	75425	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
197	NC_010815	T	6	6	75461	75466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_010815	AAG	2	6	75483	75488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_010815	CAG	2	6	76954	76959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_010815	TGAT	2	8	76984	76991	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
201	NC_010815	GAT	2	6	76999	77004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
202	NC_010815	G	7	7	77021	77027	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
203	NC_010815	AGCAA	2	10	77040	77049	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_010815	AG	3	6	77057	77062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.